La structure opérationnelle qui gère les projets ou programmes qui lui sont propres et ceux en partenariat avec d’autres Organisations. Elle répond également aux sollicitations des partenaires au développement pour des projets spécifiques par appels d’offre. La structure opérationnelle comprenait 2 pôles ou directions : le pôle Développement Local, et le pôle Langue Culture et Tradition.Cependant, ces 2 pôles ont été unifiés depuis Juillet 2016.